Các bạn cho mình hỏi, nếu kinh doanh online nhỏ lẻ thì cơ quan thuế có kiểm tra không?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, chúng tôi xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau:

1. Quy định pháp lý về nghĩa vụ thuế đối với kinh doanh online nhỏ lẻ

Theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2019, Nghị định 126/2020/NĐ-CP và Thông tư 40/2021/TT-BTC, cá nhân, hộ kinh doanh thực hiện hoạt động kinh doanh thương mại điện tử (bao gồm bán hàng online trên các nền tảng như Facebook, Shopee, TikTok Shop) phải tuân thủ nghĩa vụ kê khai và nộp thuế nếu đáp ứng ngưỡng doanh thu nhất định.

Cụ thể, nếu doanh thu hàng năm từ 100 triệu đồng trở lên, cá nhân/hộ kinh doanh phải nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT) và thuế thu nhập cá nhân (TNCN) theo tỷ lệ phần trăm trên doanh thu. Dưới mức 100 triệu đồng/năm, được miễn nộp hai loại thuế này nhưng vẫn phải nộp lệ phí môn bài nếu đăng ký hộ kinh doanh.

Đối với kinh doanh online nhỏ lẻ, pháp luật không phân biệt hình thức trực tuyến hay truyền thống. Cơ quan thuế quản lý dựa trên dữ liệu từ các sàn thương mại điện tử (theo Nghị định 117/2025/NĐ-CP hiệu lực từ 1/7/2025), nơi các nền tảng như Shopee, Lazada phải khấu trừ và nộp thay thuế GTGT và TNCN cho người bán. Điều này giúp cơ quan thuế dễ dàng theo dõi doanh thu thực tế, ngay cả với quy mô nhỏ.

2. Cơ quan thuế có kiểm tra kinh doanh online nhỏ lẻ không?

Có, cơ quan thuế hoàn toàn có quyền kiểm tra đối với kinh doanh online nhỏ lẻ. Theo Điều 108 Luật Quản lý thuế, cơ quan thuế thực hiện kiểm tra định kỳ hoặc đột xuất dựa trên dữ liệu rủi ro, thông tin từ các nền tảng số hoặc tố giác. Với kinh doanh online, việc kiểm tra trở nên phổ biến hơn nhờ Nghị quyết 198/2025/QH15 và Nghị định 70/2025/NĐ-CP, yêu cầu sử dụng hóa đơn điện tử kết nối trực tiếp với cơ quan thuế từ 1/6/2025 đối với hộ kinh doanh có doanh thu từ 1 tỷ đồng/năm trở lên.

Ngay cả với quy mô nhỏ (dưới 100 triệu đồng/năm), nếu có dấu hiệu trốn tránh thuế hoặc doanh thu không kê khai chính xác, cơ quan thuế có thể kiểm tra qua dữ liệu giao dịch ngân hàng, lượt tương tác trên mạng xã hội hoặc báo cáo từ sàn TMĐT. Thực tế, từ năm 2020, Tổng cục Thuế đã triển khai dự án quản lý thuế thương mại điện tử, dẫn đến hàng nghìn trường hợp kiểm tra và xử phạt. Ví dụ, nếu bán hàng qua Facebook mà không đăng ký mã số thuế, cơ quan thuế có thể yêu cầu bổ sung hồ sơ qua Cổng thông tin điện tử dành cho hộ kinh doanh.

3. Các rủi ro nếu không tuân thủ và cách thức kiểm tra thường gặp

Nếu không kê khai đúng, cá nhân kinh doanh online nhỏ lẻ có thể đối mặt với rủi ro xử phạt hành chính theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP (sửa đổi bổ sung năm 2025). Cụ thể: Phạt từ 2-8 triệu đồng nếu chậm nộp hồ sơ khai thuế; phạt 1-3 lần số thuế trốn tránh nếu phát hiện gian lận; thậm chí tạm hoãn xuất cảnh nếu nợ thuế từ 50 triệu đồng trở lên quá 120 ngày (Nghị định 49/2025/NĐ-CP). Ngoài ra, lãi chậm nộp là 0,03%/ngày trên số thuế nộp.

Cách thức kiểm tra thường bao gồm:

• (i) Kiểm tra hồ sơ tại chỗ qua phỏng vấn và yêu cầu sổ sách;
• (ii) Kiểm tra điện tử qua dữ liệu từ ngân hàng và sàn TMĐT;
• (iii) Thanh tra sau nếu phát hiện bất thường như doanh thu tăng đột biến.

Để giảm rủi ro, Anh/Chị nên đăng ký mã số thuế cá nhân ngay khi bắt đầu kinh doanh và sử dụng hóa đơn điện tử nếu doanh thu vượt 100 triệu đồng/năm.

Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ!