Em là công ty thi công, giám đốc em và giám đốc bên chủ đầu tư là anh em ruột, tháng 7 vừa rồi bên em có thi công lắp đặt điện nước giá trị tầm dưới 500 triệu đồng. Em có đọc giao dịch liên kết thì doanh thu 500 triệu đồng này của bên em thuộc giao dịch liên kết, vậy phần doanh thu này em kê khai sao và có bị đánh thuế gì không ạ? Anh chị có kinh nghiệm chia sẻ giúp em với ạ. Em cảm ơn.

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, chúng tôi xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau:

1. Xác định giao dịch liên kết theo quy định pháp luật

Theo khoản 2 Điều 1 Nghị định 132/2020/NĐ-CP về quản lý thuế đối với doanh nghiệp có giao dịch liên kết, giao dịch giữa hai công ty có giám đốc là anh em ruột được coi là giao dịch liên kết nếu một bên trực tiếp hoặc gián tiếp tham gia quản lý, kiểm soát, góp vốn hoặc đầu tư vào bên kia. Trong trường hợp này, giám đốc công ty thi công (bên Anh/Chị) và giám đốc công ty chủ đầu tư là anh em ruột, nên giao dịch thi công lắp đặt điện nước trị giá dưới 500 triệu đồng trong tháng 7/2025 được xác định là giao dịch liên kết.

Điều này yêu cầu Anh/Chị tuân thủ các quy định về kê khai, lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết theo Nghị định 132/2020/NĐ-CP và Thông tư 41/2021/TT-BTC, nhằm đảm bảo giá trị giao dịch phù hợp với nguyên tắc "giá thị trường" (arm’s length principle).

2. Nghĩa vụ kê khai giao dịch liên kết

Doanh thu 500 triệu đồng từ giao dịch liên kết cần được kê khai đúng quy định để tránh rủi ro bị cơ quan thuế điều chỉnh hoặc xử phạt. Các bước kê khai cụ thể như sau:

• Kê khai thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Theo khoản 3 Điều 19 Luật Thuế TNDN 2008 (sửa đổi, bổ sung 2013), doanh thu từ giao dịch thi công này được ghi nhận bình thường trong tờ khai thuế TNDN (theo mẫu 03/TNDN). Anh/Chị cần đảm bảo hóa đơn GTGT hoặc hóa đơn bán hàng được lập hợp lệ theo Nghị định 123/2020/NĐ-CP, nêu rõ giá trị thi công, thuế GTGT (nếu áp dụng), và các chứng từ liên quan như hợp đồng, biên bản nghiệm thu.
• Lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết: Theo khoản 5 Điều 6 Nghị định 132/2020/NĐ-CP, nếu tổng doanh thu năm 2025 của công ty dưới 50 tỷ đồng và tổng giá trị giao dịch liên kết dưới 30 tỷ đồng, Anh/Chị được miễn lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết. Tuy nhiên, vẫn phải điền đầy đủ thông tin vào Phụ lục I, II, III (theo mẫu tại Thông tư 41/2021/TT-BTC) kèm tờ khai quyết toán thuế TNDN cuối năm. Phụ lục này yêu cầu nêu rõ thông tin về giao dịch (giá trị, bên liên kết, mối quan hệ), phương pháp định giá, và so sánh với giá thị trường.
• Lưu trữ chứng từ: Anh/Chị cần lưu trữ hợp đồng thi công, biên bản nghiệm thu, hóa đơn, và bảng so sánh giá thị trường (nếu có) để giải trình khi cơ quan thuế yêu cầu. Ví dụ, giá thi công lắp đặt điện nước phải tương đương với giá của các công ty độc lập trên thị trường (theo báo giá hoặc hợp đồng tương tự).

Nếu giá trị giao dịch không đúng giá thị trường (ví dụ: thấp hơn đáng kể), cơ quan thuế có thể điều chỉnh lại doanh thu theo khoản 2 Điều 7 Nghị định 132/2020/NĐ-CP, dẫn đến truy thu thuế TNDN và phạt hành chính từ 1-3 triệu đồng (theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP).

3. Thuế áp dụng đối với doanh thu từ giao dịch liên kết

Doanh thu 500 triệu đồng từ giao dịch thi công chịu các loại thuế sau, tương tự như giao dịch thông thường, nhưng cần lưu ý thêm về kiểm soát giá giao dịch liên kết:

• Thuế GTGT: Nếu công ty Anh/Chị áp dụng phương pháp khấu trừ, hóa đơn GTGT được xuất với thuế suất 8% (theo Luật Thuế GTGT sửa đổi, áp dụng từ 01/1/2025) hoặc 10% tùy vào loại hình dịch vụ thi công. Thuế GTGT đầu ra (khoảng 40-50 triệu đồng) phải nộp cho cơ quan thuế theo tờ khai thuế GTGT hàng tháng/quý (mẫu 01/GTGT). Nếu áp dụng phương pháp trực tiếp, thuế GTGT tính trên tỷ lệ % doanh thu (thường 1-5% tùy ngành nghề).
• Thuế TNDN: Doanh thu 500 triệu đồng sau khi trừ chi phí hợp lệ sẽ chịu thuế TNDN 20% (theo khoản 1 Điều 11 Luật Thuế TNDN). Ví dụ, nếu lợi nhuận sau chi phí là 100 triệu đồng, thuế TNDN phải nộp là 20 triệu đồng. Cơ quan thuế sẽ kiểm tra xem chi phí đầu vào (như vật tư, nhân công) có hợp lý và tương ứng với giá thị trường hay không.
• Rủi ro truy thu: Nếu giá thi công thấp hơn giá thị trường (ví dụ: thấp hơn 20% so với báo giá trung bình), cơ quan thuế có thể điều chỉnh doanh thu lên mức giá thị trường, dẫn đến truy thu thuế TNDN và tiền chậm nộp 0,03%/ngày (theo Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019).

Để giảm rủi ro, Anh/Chị nên tham khảo báo giá thi công điện nước từ 2-3 nhà thầu độc lập, lưu trữ làm căn cứ đối chiếu giá thị trường.

Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ!