Công ty em có khoản thu nhập từ việc bán sản phẩm phần mềm (sản phẩm công nghệ thông tin). Khoản này có được miễn Thuế Thu nhập doanh nghiệp không và em cần có giấy tờ gì để chứng minh?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp đối với thu nhập từ bán sản phẩm phần mềm

Theo quy định tại Nghị định 218/2013/NĐ-CP và Thông tư 78/2014/TT-BTC (được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư 96/2015/TT-BTC), doanh nghiệp sản xuất sản phẩm phần mềm (sản phẩm công nghệ thông tin) được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) đặc biệt nếu đáp ứng các điều kiện nhất định. Cụ thể, khoản thu nhập từ bán sản phẩm phần mềm không được miễn thuế hoàn toàn mà được áp dụng các ưu đãi sau:

• Thuế suất ưu đãi 10% áp dụng trong thời hạn 15 năm kể từ khi có thu nhập chịu thuế.
• Miễn thuế TNDN trong 4 năm đầu tiên kể từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế.
• Giảm 50% số thuế TNDN phải nộp trong 9 năm tiếp theo sau thời gian miễn thuế.

Từ ngày 01/10/2025, Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15 sẽ bổ sung đối tượng đánh thuế và mở rộng các ưu đãi này, đồng thời quy định chi tiết hơn về các khoản chi phí được trừ liên quan đến hoạt động sản xuất phần mềm. Tuy nhiên, để áp dụng ưu đãi hiện hành, doanh nghiệp cần chứng minh hoạt động sản xuất phần mềm đáp ứng quy trình và sản phẩm thuộc danh mục quy định.

Điều kiện để được hưởng ưu đãi thuế

Để khoản thu nhập từ bán sản phẩm phần mềm được hưởng ưu đãi thuế TNDN, doanh nghiệp phải đáp ứng đồng thời các điều kiện sau theo Thông tư 78/2014/TT-BTC và các văn bản hướng dẫn của Bộ Thông tin và Truyền thông (BTTTT):

• Doanh nghiệp phải là dự án đầu tư mới trong lĩnh vực công nghệ thông tin, có Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc Giấy chứng nhận đầu tư.
• Sản phẩm phần mềm phải thuộc danh mục sản phẩm phần mềm và phần cứng, điện tử được ban hành tại Thông tư 09/2013/TT-BTTTT.
• Quy trình sản xuất phần mềm phải đáp ứng yêu cầu tại Thông tư 13/2020/TT-BTTTT, trong đó doanh nghiệp cần thực hiện ít nhất một trong hai công đoạn chính: (i) Xác định yêu cầu (bao gồm thu thập, phân tích nhu cầu người dùng và lập kế hoạch phát triển); hoặc (ii) Phân tích và thiết kế (bao gồm mô hình hóa hệ thống, thiết kế cơ sở dữ liệu và giao diện).
• Doanh nghiệp phải hoạt động tại địa bàn ưu đãi đầu tư hoặc thuộc lĩnh vực ưu đãi theo quy định của pháp luật đầu tư.

Nếu không đáp ứng, khoản thu nhập sẽ chịu thuế TNDN thông thường với thuế suất 20%.

Hồ sơ và thủ tục chứng minh để hưởng ưu đãi

Để chứng minh và kê khai hưởng ưu đãi thuế TNDN, doanh nghiệp cần chuẩn bị hồ sơ và thực hiện thủ tục theo quy định tại Thông tư 78/2014/TT-BTC. Hồ sơ chính bao gồm:

• Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc Giấy chứng nhận đầu tư (bản sao công chứng).
• Giấy xác nhận sản phẩm phần mềm thuộc danh mục ưu đãi do cơ quan có thẩm quyền của BTTTT cấp (dựa trên Thông tư 09/2013/TT-BTTTT).
• Giấy xác nhận quy trình sản xuất phần mềm đáp ứng yêu cầu do cơ quan chuyên ngành BTTTT cấp (theo Thông tư 13/2020/TT-BTTTT).
• Báo cáo tài chính hàng năm chứng minh thu nhập từ bán sản phẩm phần mềm và các chi phí liên quan.
• Tờ khai quyết toán thuế TNDN (mẫu 03/TNDN) kèm theo các phụ lục kê khai ưu đãi thuế.

Bước 1: Xin xác nhận sản phẩm và quy trình từ BTTTT

Doanh nghiệp nộp hồ sơ xin xác nhận tại Sở Thông tin và Truyền thông tỉnh/thành phố hoặc Cục Phát thanh, Truyền hình và Thông tin điện tử (BTTTT). Hồ sơ bao gồm mô tả sản phẩm, quy trình sản xuất và bằng chứng thực hiện công đoạn (tài liệu kỹ thuật, hợp đồng). Thời gian xử lý thường 15-30 ngày làm việc, không mất phí.

Bước 2: Kê khai và nộp hồ sơ thuế tại cơ quan thuế

Sau khi có xác nhận từ BTTTT, doanh nghiệp kê khai ưu đãi vào tờ khai thuế TNDN tạm tính hàng quý và quyết toán hàng năm tại Chi cục Thuế quản lý trực tiếp. Nộp kèm các giấy tờ chứng minh để cơ quan thuế kiểm tra và chấp thuận. Nếu phát hiện kê khai sai, doanh nghiệp có thể bị truy thu thuế và phạt từ 20% đến 100% số thuế trốn tránh theo Luật Quản lý thuế 2019.

Bước 3: Lưu trữ và kiểm tra định kỳ

Doanh nghiệp lưu trữ toàn bộ hồ sơ ít nhất 10 năm để phục vụ thanh tra thuế. Cơ quan thuế có quyền kiểm tra đột xuất hoặc định kỳ để xác minh tính hợp lệ của ưu đãi.

Việc tuân thủ các quy định trên giúp doanh nghiệp tối ưu hóa chi phí thuế, thúc đẩy phát triển hoạt động sản xuất phần mềm bền vững và tránh rủi ro pháp lý. Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ Công Ty Luật ACC.