Cho em hỏi em có chứng từ thuế rồi nhưng bên cơ quan thuế báo công ty chưa kê khai thuế, bây giờ làm sao ạ? Em cảm ơn.

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Xử lý hồ sơ khai thuế chậm nộp

Khi công ty chưa kê khai thuế theo thời hạn quy định, đây được coi là trường hợp chậm nộp hồ sơ khai thuế. Theo Luật Quản lý thuế 2019, người nộp thuế phải thực hiện khai thuế đúng thời hạn, và nếu chậm nộp, cơ quan thuế sẽ áp dụng các biện pháp xử lý hành chính. Nghị định 126/2020/NĐ-CP quy định thời hạn nộp hồ sơ khai thuế là ngày cuối cùng của tháng tiếp theo kỳ tính thuế (đối với khai theo tháng) hoặc ngày cuối cùng của tháng thứ 90 kể từ ngày kết thúc kỳ tính thuế (đối với khai theo quý hoặc năm). Việc chậm nộp không làm mất hiệu lực của các chứng từ kinh doanh, nhưng công ty phải kê khai bổ sung để hợp thức hóa.

Xử lý chứng từ liên quan đến hoạt động kinh doanh

Các chứng từ như hóa đơn giá trị gia tăng, chứng từ kế toán, hợp đồng kinh doanh vẫn giữ giá trị pháp lý ban đầu, nhưng phải được đưa vào hồ sơ khai thuế bổ sung để tính toán nghĩa vụ thuế. Theo Luật Quản lý thuế 2019, cơ quan thuế có quyền yêu cầu người nộp thuế cung cấp chứng từ để kiểm tra, xác minh. Nếu chứng từ chưa được kê khai, công ty cần lập tờ khai bổ sung theo mẫu quy định kèm theo các chứng từ gốc hoặc sao y. Việc này giúp tránh rủi ro bị từ chối khấu trừ thuế đầu vào hoặc bị truy thu thuế kèm phạt.

Quy trình kê khai bổ sung và xử lý chứng từ

Để xử lý chứng từ khi chưa kê khai thuế, công ty cần thực hiện kê khai bổ sung theo quy trình sau, đảm bảo tuân thủ thời hạn để giảm thiểu mức phạt.

Bước 1: Kiểm tra và tổng hợp chứng từ

Công ty rà soát toàn bộ chứng từ liên quan đến kỳ thuế chưa kê khai, bao gồm hóa đơn đầu vào/đầu ra, chứng từ thanh toán và sổ sách kế toán. Tổng hợp dữ liệu để tính toán số thuế phải nộp, khấu trừ theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2019. Việc này giúp xác định chính xác nghĩa vụ tài chính, tránh sai sót khi nộp bổ sung.

Bước 2: Lập và nộp tờ khai bổ sung

Lập tờ khai thuế bổ sung theo mẫu tại Nghị định 126/2020/NĐ-CP, ghi rõ lý do chậm nộp và đính kèm chứng từ liên quan. Nộp hồ sơ qua hệ thống điện tử iHTKK hoặc trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp. Thời hạn nộp bổ sung không muộn hơn 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế ban đầu.

Bước 3: Nộp thuế và chịu xử phạt

Tính và nộp số thuế phát sinh kèm tiền chậm nộp (0,03%/ngày theo Điều 59 Luật Quản lý thuế 2019). Đồng thời, chấp hành xử phạt hành chính theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP (không được đề cập chi tiết trong thông tin tham chiếu nhưng liên quan), với mức phạt từ 2.000.000 đồng đến 25.000.000 đồng đối với chậm nộp hồ sơ từ 1-30 ngày, tùy mức độ vi phạm.

Bước 4: Theo dõi và hoàn tất thủ tục

Sau khi nộp, theo dõi thông báo từ cơ quan thuế qua cổng thông tin điện tử. Nếu có khiếu nại về xử lý chứng từ, công ty có quyền khiếu nại theo Luật Quản lý thuế 2019. Hoàn tất bằng cách cập nhật sổ sách kế toán để tránh lặp lại vi phạm.

Nghĩa vụ tài chính phát sinh

Ngoài nộp thuế bổ sung, công ty phải chịu tiền chậm nộp thuế (0,03%/ngày trên số thuế chậm nộp) và phạt hành chính theo Nghị định 126/2020/NĐ-CP. Các chứng từ sẽ được cơ quan thuế kiểm tra để xác nhận tính hợp lệ, đảm bảo không bị loại trừ khỏi khấu trừ thuế.

Việc tuân thủ kịp thời các quy định về kê khai thuế giúp doanh nghiệp tránh các khoản phạt nặng nề, duy trì uy tín và dòng tiền ổn định. Đồng thời, nó đảm bảo chứng từ kinh doanh được sử dụng hiệu quả trong các giao dịch sau. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công Ty Luật ACC.

Lưu ý: Nội dung trên được tổng hợp và biên soạn nhằm cung cấp thông tin tham khảo cho người đọc. Do quy định pháp luật, chính sách và dữ liệu có thể thay đổi theo thời gian, ACC không cam kết thông tin luôn chính xác hoặc cập nhật đầy đủ tại mọi thời điểm. Trường hợp cần áp dụng vào thực tế hoặc giải quyết vấn đề cụ thể, Quý khách vui lòng tham khảo ý kiến từ chuyên gia hoặc đơn vị tư vấn chuyên môn. Trường hợp phát hiện nội dung có sai sót, vui lòng phản hồi để ACC rà soát và cập nhật kịp thời.