Nếu công ty em làm thủ tục khai thuế bổ sung cho tờ khai Thuế Thu nhập doanh nghiệp của năm trước và làm tăng số thuế phải nộp, nhưng lúc đó công ty đang có một khoản thuế nộp thừa của kỳ khác. Em có thể dùng khoản nộp thừa đó để bù trừ ngay không?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Khả năng bù trừ thuế nộp thừa với số thuế phát sinh từ khai bổ sung

Theo quy định tại Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 và Thông tư 80/2021/TT-BTC hướng dẫn thi hành một số điều của Luật này cũng như Nghị định 126/2020/NĐ-CP, doanh nghiệp hoàn toàn có thể sử dụng khoản thuế nộp thừa từ kỳ khác để bù trừ với số thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN) phát sinh phải nộp thêm từ việc khai bổ sung tờ khai của năm trước. Việc bù trừ này được thực hiện theo nguyên tắc tự động nếu đáp ứng các điều kiện cụ thể, nhằm đảm bảo quyền lợi của người nộp thuế và tránh tình trạng nộp thừa hoặc chậm nộp. Cụ thể, khoản nộp thừa chỉ được bù trừ với số thuế TNDN phải nộp của cùng tiểu mục thu ngân sách nhà nước (NSNN) và thuộc kỳ tiếp theo, không áp dụng cho các loại thuế khác hoặc tiểu mục khác.

Điều kiện để bù trừ tự động

Để thực hiện bù trừ mà không cần nộp hồ sơ bổ sung, khoản thuế nộp thừa phải đáp ứng các điều kiện sau theo Khoản 2, Điều 25 Thông tư 80/2021/TT-BTC:

• Phải thuộc cùng một loại thuế (ở đây là thuế TNDN) và cùng tiểu mục thu NSNN (ví dụ: tiểu mục 1103 cho thuế TNDN theo Mẫu 03/TNDN).
• Thuộc cùng địa bàn thu NSNN (cùng cơ quan thuế quản lý).
• Khoản nộp thừa phát sinh từ kỳ trước đó và được cơ quan thuế xác nhận (thông qua quyết toán hoặc thông báo chính thức).

Nếu các điều kiện trên được đáp ứng, hệ thống quản lý thuế điện tử sẽ tự động khấu trừ mà không yêu cầu doanh nghiệp thực hiện thêm thủ tục, giúp tiết kiệm thời gian và tránh phát sinh lãi chậm nộp (lãi suất 0,03%/ngày theo Điều 59 Luật Quản lý thuế 2019).

Quy trình thực hiện bù trừ nếu không đủ điều kiện tự động

Trong trường hợp khoản nộp thừa không đáp ứng điều kiện tự động (ví dụ: khác tiểu mục hoặc địa bàn thu), doanh nghiệp cần thực hiện thủ tục bù trừ theo quy định tại Khoản 2, Điều 25 Thông tư 80/2021/TT-BTC. Quy trình được thực hiện như sau:

Bước 1: Kê khai và nộp tờ khai bổ sung

Doanh nghiệp thực hiện khai bổ sung tờ khai thuế TNDN năm trước qua hệ thống iHTKK hoặc eTax, dẫn đến tăng số thuế phải nộp. Sau khi cơ quan thuế tiếp nhận và xử lý (thường trong 3-5 ngày làm việc), số thuế phát sinh sẽ được ghi nhận chính thức.

Bước 2: Kiểm tra và xác định khoản nộp thừa

Doanh nghiệp kiểm tra tài khoản thuế trên hệ thống eTax để xác nhận khoản nộp thừa từ kỳ khác, kèm theo thông báo nộp thừa từ cơ quan thuế (nếu có). Nếu cần, yêu cầu cơ quan thuế cấp văn bản xác nhận số dư nộp thừa theo Điều 116 Luật Quản lý thuế 2019.

Bước 3: Nộp hồ sơ đề nghị bù trừ

Nộp hồ sơ tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp, bao gồm:

• Văn bản đề nghị bù trừ (theo Mẫu 01/ĐN-BT ban hành kèm Thông tư 80/2021/TT-BTC).
• Bản sao tờ khai thuế TNDN bổ sung đã được cơ quan thuế chấp nhận.
• Bản sao thông báo nộp thừa hoặc sao kê tài khoản thuế chứng minh khoản nộp thừa.
• Các tài liệu liên quan khác nếu cơ quan thuế yêu cầu (như biên lai nộp thuế).

Hồ sơ có thể nộp trực tiếp hoặc qua cổng thông tin điện tử, và cơ quan thuế sẽ xử lý trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ.

Bước 4: Theo dõi và hoàn tất

Sau khi cơ quan thuế chấp thuận, khoản bù trừ sẽ được ghi nhận vào tài khoản thuế, và doanh nghiệp nhận thông báo kết quả. Nếu có phần dư thừa sau bù trừ, doanh nghiệp có quyền yêu cầu hoàn thuế theo quy định tại Điều 60 Luật Quản lý thuế 2019.

Việc tuân thủ đúng quy định giúp doanh nghiệp tránh các rủi ro pháp lý, giảm thiểu chi phí phát sinh từ lãi chậm nộp và tối ưu hóa dòng tiền. Đồng thời, đảm bảo tính minh bạch trong quản lý thuế, tránh các tranh chấp sau này. Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ Công Ty Luật ACC.