Tôi phát hiện công ty cũ kê khai sai mức thu nhập khiến số thuế bị khấu trừ cao hơn thực tế, giờ đã nghỉ việc rồi thì tôi tự điều chỉnh để hoàn thuế được không?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Điều kiện thực hiện khai bổ sung, điều chỉnh hồ sơ khai thuế

Theo quy định tại Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019, người nộp thuế (bao gồm công ty) được phép tự khai bổ sung, điều chỉnh hồ sơ khai thuế khi phát hiện sai sót trong hồ sơ đã nộp, nhằm đảm bảo tính chính xác và minh bạch. Trường hợp kê khai sai thu nhập dẫn đến nộp thừa số thuế (ví dụ: thu nhập bị khai thấp hơn thực tế, gây nộp thừa thuế thu nhập doanh nghiệp), công ty có quyền tự điều chỉnh để yêu cầu hoàn thuế, miễn là thực hiện trước khi cơ quan thuế ban hành quyết định kiểm tra, thanh tra hoặc kiểm toán quyết toán thuế.

Nghị định số 126/2020/NĐ-CP của Chính phủ (khoản 1 Điều 47) quy định rõ, việc điều chỉnh phải được thực hiện trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết hạn nộp hồ sơ khai thuế ban đầu, và không áp dụng nếu sai sót thuộc trường hợp trốn thuế cố ý. Việc tự điều chỉnh giúp tránh các chế tài phạt hành chính, với mức phạt từ 20% đến 100% số tiền thuế kê khai thiếu (theo Điều 142 Luật Quản lý thuế 2019), đồng thời tạo cơ sở pháp lý để hoàn thuế nộp thừa.

Hồ sơ cần chuẩn bị

Để thực hiện khai bổ sung, điều chỉnh, công ty cần lập hồ sơ theo hướng dẫn tại Điều 47 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, bao gồm các tài liệu sau:

• Tờ khai bổ sung, điều chỉnh theo mẫu quy định (Mẫu 01/TS-BS hoặc tương đương tùy loại thuế).
• Giấy tờ chứng minh sai sót, như báo cáo tài chính điều chỉnh, hợp đồng kinh tế, hóa đơn chứng từ liên quan đến thu nhập bị kê khai sai.
• Bản giải trình lý do điều chỉnh, nêu rõ sự khác biệt giữa hồ sơ cũ và mới, kèm tính toán số thuế nộp thừa cần hoàn.
• Các tài liệu hỗ trợ khác nếu cơ quan thuế yêu cầu bổ sung, như biên bản họp nội bộ công ty về phát hiện sai sót.

Quy trình thực hiện khai bổ sung, điều chỉnh để hoàn thuế

Quy trình được thực hiện theo trình tự tại Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019 và Điều 47 Nghị định 126/2020/NĐ-CP, nhằm đảm bảo tính kịp thời và tuân thủ. Công ty có thể nộp trực tiếp hoặc qua hệ thống điện tử (eTax).

Bước 1: Phát hiện và xác định sai sót

Công ty rà soát nội bộ hồ sơ khai thuế, xác định cụ thể phần thu nhập bị kê khai sai (ví dụ: thu nhập từ bán hàng hoặc dịch vụ bị ghi nhận thiếu). Lập báo cáo nội bộ ghi nhận sai sót và tính toán số thuế nộp thừa, dựa trên quy định tại Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025. Thời gian thực hiện bước này nên nhanh chóng để tránh hết thời hạn 10 năm.

Bước 2: Lập và nộp hồ sơ bổ sung

Chuẩn bị hồ sơ theo danh sách trên, ký số điện tử nếu nộp online. Nộp tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp (cục Thuế khu vực hoặc Cục Thuế tỉnh/thành phố) trong vòng 10 ngày kể từ ngày phát hiện sai sót (nếu không có lý do bất khả kháng). Nếu điều chỉnh dẫn đến giảm số thuế phải nộp, cơ quan thuế sẽ kiểm tra và xác nhận số tiền hoàn trong vòng 6 tháng (theo Điều 60 Luật Quản lý thuế 2019).

Bước 3: Theo dõi và nhận hoàn thuế

Sau khi nộp, công ty theo dõi phản hồi từ cơ quan thuế qua cổng thông tin điện tử. Nếu được chấp thuận, số thuế nộp thừa sẽ được hoàn trực tiếp vào tài khoản ngân hàng của công ty trong vòng 40 ngày (Điều 60 Nghị định 126/2020/NĐ-CP). Trường hợp cơ quan thuế từ chối, công ty có quyền khiếu nại theo thủ tục tại Điều 114 Luật Quản lý thuế 2019. Nếu phát sinh phạt chậm nộp (0,03%/ngày trên số tiền hoàn), công ty cần chứng minh không cố ý để được miễn.

Việc tuân thủ quy trình này không chỉ giúp công ty khắc phục sai sót mà còn tránh rủi ro pháp lý, tối ưu hóa dòng tiền qua hoàn thuế hợp pháp. Đồng thời, duy trì uy tín với cơ quan nhà nước, giảm thiểu chi phí phát sinh từ kiểm tra sau này. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công Ty Luật ACC.