Công ty em kê khai thiếu doanh thu bán hàng, cơ quan thuế phát hiện thì sẽ xử lý ra sao, có bị phạt nặng không?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Hậu quả khi cơ quan thuế phát hiện kê khai thiếu doanh thu

Khi công ty kê khai thiếu doanh thu bán hàng và bị cơ quan thuế phát hiện qua thanh tra, kiểm tra hoặc các biện pháp quản lý khác, cơ quan thuế sẽ tiến hành xử lý theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2019 và Nghị định 125/2020/NĐ-CP. Cụ thể, công ty sẽ bị truy thu toàn bộ số tiền thuế thiếu (bao gồm thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập doanh nghiệp hoặc các loại thuế liên quan đến doanh thu). Đồng thời, công ty phải nộp tiền chậm nộp tính theo mức 0,03%/ngày trên số tiền thuế chậm nộp, tính từ ngày hết hạn nộp thuế đến ngày nộp đủ. Nếu hành vi kê khai thiếu có dấu hiệu cố ý trốn tránh nghĩa vụ thuế, cơ quan thuế có thể chuyển hồ sơ sang cơ quan điều tra để xử lý hình sự theo Bộ luật Hình sự 2015 (sửa đổi, bổ sung 2017), với mức phạt tù từ 3 tháng đến 7 năm tùy mức độ thiệt hại.

Mức xử phạt vi phạm hành chính

Theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP quy định xử phạt vi phạm hành chính về thuế, hóa đơn, hành vi kê khai thiếu doanh thu được coi là vi phạm về khai thuế sai sót. Mức phạt cụ thể phụ thuộc vào giá trị số thuế kê khai thiếu và các tình tiết tăng nặng (như cố ý, tái phạm) hoặc giảm nhẹ (tự nguyện khắc phục).

• Phạt cảnh cáo nếu số thuế thiếu dưới 10% tổng số thuế phải nộp và không gây thiệt hại lớn.
• Phạt tiền từ 20% đến 100% số tiền thuế kê khai thiếu, với mức tối thiểu từ 2.000.000 đồng đến 25.000.000 đồng đối với vi phạm lần đầu; nếu tái phạm hoặc số tiền lớn, mức phạt có thể lên đến 50.000.000 đồng hoặc gấp 3 lần số thuế trốn.

Mức phạt có thể được coi là nặng nếu số doanh thu thiếu lớn (ví dụ: trên 100 triệu đồng), dẫn đến tổng số tiền phạt, truy thu và chậm nộp có thể vượt hàng trăm triệu đồng, ảnh hưởng nghiêm trọng đến hoạt động kinh doanh của công ty.

Để tránh bị xử phạt nặng, công ty nên chủ động rà soát và khai bổ sung hồ sơ thuế theo Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019, giúp giảm hoặc miễn một phần mức phạt nếu thực hiện trước khi cơ quan thuế phát hiện. Quy trình khai bổ sung được thực hiện như sau:

Bước 1: Rà soát và xác định số liệu thiếu

Công ty tự kiểm tra lại sổ sách kế toán, hóa đơn bán hàng và các chứng từ liên quan để xác định chính xác số doanh thu thiếu và số thuế phải nộp bổ sung. Việc này cần được thực hiện bởi bộ phận kế toán hoặc chuyên gia thuế, đảm bảo tính chính xác để tránh sai sót thêm. Thời hạn tự giác khai bổ sung không giới hạn, nhưng nên làm sớm để giảm tiền chậm nộp.

Bước 2: Lập và nộp hồ sơ khai bổ sung

Chuẩn bị tờ khai thuế bổ sung theo mẫu quy định tại Nghị định 125/2020/NĐ-CP, kèm theo giải trình lý do kê khai thiếu và các chứng từ chứng minh (như hóa đơn, hợp đồng bán hàng). Nộp hồ sơ trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý hoặc qua hệ thống điện tử iHTKK/cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế. Cơ quan thuế sẽ tiếp nhận và xác nhận trong vòng 3-5 ngày làm việc.

Bước 3: Nộp đủ thuế, tiền chậm nộp và chờ quyết định xử lý

Sau khi nộp hồ sơ, công ty nộp ngay số thuế thiếu và tiền chậm nộp (tính đến ngày nộp). Cơ quan thuế sẽ xem xét tình tiết giảm nhẹ, có thể chỉ phạt từ 10-20% số thuế thiếu thay vì mức cao hơn nếu phát hiện sau. Nếu cần, công ty có quyền khiếu nại quyết định xử phạt theo Luật Khiếu nại 2011.

Việc chủ động khai bổ sung không chỉ giúp giảm mức phạt mà còn tránh rủi ro hình sự, đồng thời duy trì uy tín với cơ quan thuế.

Việc tuân thủ nghiêm ngặt quy định về kê khai thuế giúp doanh nghiệp tránh các rủi ro tài chính và pháp lý lâu dài, đồng thời tối ưu hóa chi phí quản lý. Chủ động khắc phục sai sót sẽ mang lại lợi ích lớn hơn so với chờ xử lý từ cơ quan nhà nước. Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ Công Ty Luật ACC.