Nếu kế toán lỡ khai thuế GTGT đầu ra cao hơn thực tế và đã nộp tiền, có được hoàn lại phần chênh không ạ?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Điều kiện hoàn thuế GTGT nộp thừa

Theo quy định tại Luật Thuế giá trị gia tăng 2024, tổ chức, cá nhân kinh doanh được hoàn lại số tiền thuế GTGT đã nộp thừa nếu kê khai và nộp cao hơn số thuế phải nộp thực tế. Cụ thể, trường hợp khai sai dẫn đến nộp thừa phải được phát hiện qua quyết toán thuế hoặc kiểm tra sau thuế, và số tiền thừa phải được xác định rõ ràng dựa trên chứng từ hợp lệ. Điều này nhằm đảm bảo quyền lợi của người nộp thuế, tránh thiệt hại không đáng có từ lỗi kê khai. Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định chi tiết thi hành Luật Thuế GTGT cũng xác nhận rằng, nếu số thuế đầu ra khai cao hơn thực tế và đã nộp, người nộp thuế có quyền yêu cầu hoàn trong thời hạn 2 năm kể từ ngày nộp thừa, miễn là không thuộc trường hợp vi phạm cố ý dẫn đến truy thu.

Hồ sơ cần chuẩn bị

Để yêu cầu hoàn thuế, Anh/Chị cần chuẩn bị đầy đủ hồ sơ theo quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP và các hướng dẫn liên quan từ cơ quan thuế. Các tài liệu chính bao gồm:

• Tờ khai điều chỉnh thuế GTGT, kèm giải trình lý do khai sai và số tiền chênh lệch cụ thể.
• Bản sao chứng từ kế toán chứng minh doanh thu thực tế (hóa đơn GTGT đầu vào/đầu ra, sổ sách kế toán), chứng tỏ số thuế đầu ra thực tế thấp hơn đã khai.
• Biên lai nộp thuế GTGT thừa, kèm xác nhận của ngân hàng hoặc kho bạc nhà nước.
• Giấy ủy quyền nếu ủy thác cho người khác nộp hồ sơ.

Hồ sơ phải được lập thành bộ, ký xác nhận của người đại diện pháp luật, và nộp trực tiếp hoặc qua hệ thống điện tử iHTKK của Tổng cục Thuế.

Quy trình yêu cầu hoàn thuế

Quy trình hoàn thuế GTGT nộp thừa được thực hiện theo các bước sau, dựa trên Nghị định 181/2025/NĐ-CP, nhằm đảm bảo tính minh bạch và nhanh chóng.

Bước 1: Điều chỉnh tờ khai thuế

Trước tiên, Anh/Chị cần lập và nộp tờ khai điều chỉnh thuế GTGT cho kỳ kê khai sai tại Chi cục Thuế quản lý trực tiếp. Giải trình chi tiết lỗi khai (ví dụ: nhầm lẫn số liệu đầu ra) và tính toán lại số thuế phải nộp thực tế. Cơ quan thuế sẽ kiểm tra sơ bộ trong vòng 3 ngày làm việc và chấp nhận điều chỉnh nếu hồ sơ hợp lệ, từ đó xác định số tiền nộp thừa.

Bước 2: Nộp hồ sơ yêu cầu hoàn thuế

Sau khi điều chỉnh được chấp nhận, nộp hồ sơ hoàn thuế tại Chi cục Thuế nơi đăng ký kinh doanh. Hồ sơ bao gồm các tài liệu nêu trên, và cơ quan thuế sẽ tiếp nhận, kiểm tra tính đầy đủ trong 3 ngày làm việc. Nếu thiếu, họ sẽ hướng dẫn bổ sung; nếu hợp lệ, cấp giấy tiếp nhận và tiến hành xác minh.

Bước 3: Xác minh và quyết định hoàn thuế

Cơ quan thuế kiểm tra thực tế hồ sơ, có thể yêu cầu bổ sung chứng từ trong vòng 40 ngày kể từ ngày nhận hồ sơ. Nếu xác nhận nộp thừa, họ ban hành quyết định hoàn thuế bằng văn bản, kèm số tiền cụ thể (ví dụ: hoàn 50.000.000 đồng nếu chênh lệch đã nộp). Trường hợp từ chối, phải thông báo lý do bằng văn bản để Anh/Chị khiếu nại.

Bước 4: Nhận hoàn thuế

Sau quyết định, cơ quan thuế chuyển khoản hoàn tiền vào tài khoản ngân hàng của Anh/Chị trong vòng 30 ngày. Nếu chậm trễ, áp dụng lãi chậm hoàn theo mức 0,03%/ngày trên số tiền hoàn, theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2019 (sửa đổi, bổ sung).

Việc tuân thủ đúng quy trình giúp tránh rủi ro phạt hành chính (từ 2.000.000 đồng đến 25.000.000 đồng nếu chậm điều chỉnh) và đảm bảo dòng tiền kinh doanh ổn định.

Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công Ty Luật ACC.