Cho tôi hỏi khi làm quyết toán thuế cá nhân mà hệ thống tính ra số thuế được hoàn khá lớn thì có khả năng hồ sơ bị kiểm tra kỹ hơn hoặc phải giải trình thêm không?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công Ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Điều kiện hoàn thuế và rủi ro kiểm tra với số thuế lớn

Theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2019 (Điều 60), người nộp thuế có quyền được hoàn thuế nếu đáp ứng các điều kiện về hồ sơ, thời hạn kê khai và không có nợ thuế khác. Số thuế hoàn lớn (thường từ hàng trăm triệu đồng trở lên, tùy theo quy mô doanh nghiệp) không bị cấm hoàn nhưng sẽ thu hút sự chú ý cao hơn từ cơ quan thuế để tránh rủi ro gian lận hoặc sai sót. Nghị định số 126/2020/NĐ-CP (Điều 28) quy định chi tiết rằng cơ quan thuế có quyền ưu tiên kiểm tra các trường hợp hoàn thuế lớn nhằm đảm bảo tính chính xác, hợp pháp của số tiền đề nghị hoàn, giúp bảo vệ nguồn thu ngân sách nhà nước.

Quy trình kiểm tra sau hoàn thuế

Quy trình kiểm tra sau hoàn thuế được thực hiện theo Luật Quản lý thuế 2019 (Điều 60) và Nghị định số 126/2020/NĐ-CP (Điều 28, 29), áp dụng đặc biệt với số hoàn lớn để xác minh tính trung thực của hồ sơ. Thời hạn kiểm tra thường trong vòng 10 ngày kể từ ngày hoàn thuế, nhưng có thể kéo dài nếu phát hiện dấu hiệu bất thường. Dưới đây là các bước chính trong quy trình:

Bước 1: Quyết định kiểm tra

Cơ quan thuế ra quyết định kiểm tra sau hoàn thuế trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày hoàn thành thủ tục hoàn thuế. Với số hoàn lớn, quyết định này thường được ưu tiên dựa trên dữ liệu rủi ro (như lịch sử kê khai hoặc tỷ lệ hoàn cao bất thường). Người nộp thuế sẽ nhận thông báo bằng văn bản, nêu rõ phạm vi kiểm tra và thời gian hợp tác.

Bước 2: Thực hiện kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế

Cơ quan thuế cử đoàn kiểm tra đến trụ sở người nộp thuế để rà soát hồ sơ, chứng từ liên quan đến số thuế hoàn (như hóa đơn, hợp đồng, báo cáo tài chính). Quy trình này có thể kéo dài 10-30 ngày, tập trung vào việc xác minh tính hợp pháp của các khoản khấu trừ hoặc hoàn giá trị gia tăng. Người nộp thuế phải cung cấp đầy đủ tài liệu theo yêu cầu, tránh tình trạng chậm trễ dẫn đến xử phạt.

Bước 3: Lập biên bản và xử lý kết quả

Sau kiểm tra, cơ quan thuế lập biên bản kết quả, thông báo cho người nộp thuế trong thời hạn 5 ngày. Nếu phát hiện sai sót, có thể thu hồi số hoàn đã trả (kèm lãi chậm nộp theo mức 0,03%/ngày theo Luật Quản lý thuế) hoặc xử phạt hành chính từ 20% đến 100% số thuế gian lận (theo Nghị định 126/2020/NĐ-CP, mức phạt từ 2.000.000 đồng đến 100.000.000 đồng tùy mức độ). Nếu không có vấn đề, quy trình kết thúc mà không ảnh hưởng đến số hoàn.

Hồ sơ cần chuẩn bị để giảm rủi ro kiểm tra

Để tránh kiểm tra kỹ lưỡng hoặc chậm trễ, người nộp thuế nên chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế đầy đủ theo Luật Quản lý thuế 201 (Điều 59) và Nghị định 126/2020/NĐ-CP (Điều 27):

• Tờ khai hoàn thuế theo mẫu quy định.
• Chứng từ chứng minh số thuế nộp thừa (hóa đơn GTGT, biên lai nộp thuế).
• Báo cáo tài chính và sổ sách kế toán liên quan đến kỳ hoàn.
• Giấy tờ chứng minh không nợ thuế khác (trích lục thông tin thuế từ cơ quan thuế).
• Các tài liệu bổ sung nếu hoàn thuế lớn, như hợp đồng kinh tế hoặc xác nhận từ đối tác.

Việc tuân thủ nghiêm ngặt các quy định giúp giảm thiểu rủi ro bị kiểm tra sâu, tránh phạt hành chính và đảm bảo dòng tiền ổn định cho doanh nghiệp. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công Ty Luật ACC.