Công ty ký hợp đồng xây dựng với chủ đầu tư theo hình thức thanh toán theo tiến độ, mỗi lần nghiệm thu một phần công trình sẽ thanh toán tương ứng, vậy thuế giá trị gia tăng kê khai theo từng lần nghiệm thu hay khi hoàn thành toàn bộ công trình?

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, Công ty Luật ACC xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau.

Cơ sở pháp lý

Nghĩa vụ thuế GTGT đối với hoạt động xây dựng được điều chỉnh bởi các văn bản quy phạm pháp luật hiện hành sau:

• Luật Thuế giá trị gia tăng số 13/2008/QH12 (đã được sửa đổi, bổ sung bởi các Luật số 31/2013/QH13,71/2014/QH13, 106/2016/QH13 và các văn bản liên quan).
• Thông tư 219/2013/TT-BTC hướng dẫn thi hành Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Nghị định 123/2020/NĐ-CP quy định về hóa đơn, chứng từ.
• Thông tư 80/2021/TT-BTC hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Quản lý thuế.

Theo đó, thời điểm xác định thuế GTGT đối với hoạt động xây dựng, lắp đặt (bao gồm cả đóng tàu) là thời điểm nghiệm thu, bàn giao công trình, hạng mục công trình, khối lượng xây dựng, lắp đặt hoàn thành, không phân biệt đã thu được tiền hay chưa thu được tiền.

Quy trình kê khai thuế GTGT theo tiến độ nghiệm thu

Doanh nghiệp cần thực hiện trình tự các bước kê khai và nộp thuế theo quy định để đảm bảo tính hợp lệ của hóa đơn đầu ra và quyền khấu trừ đầu vào như sau:Bước 1: Lập hóa đơn điện tử dựa trên biên bản nghiệm thu khối lượng hoàn thành Ngay sau khi các bên ký kết biên bản nghiệm thu khối lượng công việc hoàn thành theo giai đoạn hoặc theo hạng mục, nhà thầu có nghĩa vụ lập hóa đơn điện tử GTGT cho phần giá trị tương ứng với thuế suất 10%. Việc lập hóa đơn phải thực hiện đúng thời điểm nghiệm thu theo quy định tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP, ngay cả khi chủ đầu tư chưa thanh toán tiền nhằm đảm bảo tính minh bạch trong việc ghi nhận doanh thu tính thuế. Nếu doanh nghiệp chậm trễ trong việc lập hóa đơn so với ngày trên biên bản nghiệm thu, cơ quan thuế có thể áp dụng mức phạt hành chính từ 4.000.000 đồng đến 8.000.000 đồng cho hành vi lập hóa đơn không đúng thời điểm theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.Bước 2: Thực hiện kê khai thuế GTGT đầu ra theo kỳ tính thuế quy định Doanh nghiệp căn cứ vào tổng giá trị hóa đơn đã lập trong kỳ (tháng hoặc quý) để đưa vào chỉ tiêu doanh thu chịu thuế trên tờ khai thuế GTGT mẫu số 01/GTGT. Thời hạn nộp tờ khai chậm nhất là ngày 20 của tháng tiếp theo (đối với kê khai theo tháng) hoặc ngày cuối cùng của tháng đầu quý tiếp theo (đối với kê khai theo quý) theo hướng dẫn tại Thông tư 80/2021/TT-BTC. Việc kê khai đúng kỳ giúp doanh nghiệp đối soát chính xác số thuế GTGT đầu vào của các nguyên vật liệu, nhân công phục vụ riêng cho hạng mục đã nghiệm thu, từ đó xác định chính xác số thuế phải nộp vào ngân sách nhà nước và tránh rủi ro bị truy thu khi có hoạt động hậu kiểm từ cơ quan chức năng.Bước 3: Nộp thuế và đối trừ số thuế GTGT đầu vào phát sinh trong kỳ Sau khi xác định số thuế GTGT phải nộp trên tờ khai, doanh nghiệp thực hiện nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước thông qua cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế hoặc ngân hàng thương mại. Tại bước này, kế toán cần kiểm tra kỹ số thuế đầu vào từ các hóa đơn mua vật tư, máy móc dùng cho công trình để thực hiện khấu trừ tối đa, giúp giảm nhẹ áp lực tài chính cho doanh nghiệp tại từng giai đoạn thi công. Nếu phát sinh số thuế chậm nộp, doanh nghiệp phải nộp thêm tiền chậm nộp tính theo mức 0,03%/ngày trên số tiền thuế chậm nộp (ví dụ: nếu chậm nộp 100.000.000 đồng trong 10 ngày, số tiền phạt chậm nộp tương ứng là 300.000 đồng) theo quy định của Luật Quản lý thuế 2019 (sửa đổi, bổ sung năm 2019).

Tuân thủ quy định này giúp doanh nghiệp tránh các chế tài hành chính như phạt chậm nộp thuế từ 0,03%/ngày trên số tiền chậm nộp (theo Điều 13 Nghị định 125/2020/NĐ-CP), đồng thời tối ưu hóa dòng tiền và giảm thiểu tranh chấp với cơ quan thuế. Việc kê khai đúng tiến độ còn hỗ trợ chủ đầu tư khấu trừ thuế đầu vào kịp thời, góp phần nâng cao hiệu quả quản lý tài chính dự án. Nếu cần hỗ trợ soạn thảo, nộp hồ sơ hoặc theo dõi tiến trình, hãy liên hệ Công ty Luật ACC.