Anh/chị ơi, giúp em trường hợp với ạ. Địa chỉ em đăng ký thuộc thuế cơ sở 6 nhưng đầu tháng 8 bên thuế cơ sở 13 lại đăng ký thông tin của em bên đó. Cái này em cũng không rõ vì sao bên thuế cơ sở 13 lại tiếp nhận được thông tin của em để đăng ký được. Nhưng hôm 13/8, em có làm tờ khai 02/TMĐT khai thuế bên cơ sở 6, chờ mãi không thấy tiếp nhận hồ sơ. Em sợ lỗi hệ thống nên đã tự khai lại. Lần khai thứ hai là ngày 19/8, em vẫn nộp tờ khai chính thức, lúc này tờ khai lại hiện cơ quan thuế là cơ sở 13. Chiều ngày 19/8, em có lên thuế cơ sở 13 yêu cầu đổi thông tin về cơ sở 6. Sau khi đổi được xong thì em nhận được thông báo tiếp nhận tờ khai và nộp thuế tại cơ sở 13. Hiện tại trên Etax của em đang hiện số tiền phải đóng ở bên thuế cơ sở 13. Vậy giờ em vẫn cứ để nguyên như thế không đóng tiền, chờ thuế cơ sở 6 tiếp nhận tờ khai hôm 13/8 hay là em phải làm giấy hủy tờ khai ở thuế cơ sở 13 ạ? Giờ em không biết phải làm sao, anh/chị giúp em với ạ.

Dựa trên thông tin Anh/Chị cung cấp, chúng tôi xin phép phân tích và đưa ra hướng dẫn cụ thể như sau:

1. Phân tích tình huống hiện tại

Theo mô tả, địa chỉ đăng ký của Anh/Chị thuộc phạm vi quản lý của cơ sở thuế 6 (có thể là Chi cục Thuế quận/huyện tương ứng), nhưng hệ thống Etax đã ghi nhận thông tin tại cơ sở thuế 13 do lỗi hệ thống hoặc sai sót trong quá trình đăng ký đầu tháng 8. Tờ khai 02/TMĐT (Tờ khai thuế đối với hộ, cá nhân có hoạt động kinh doanh thương mại điện tử theo Nghị định 117/2025) nộp ngày 13/8 tại cơ sở 6 chưa được tiếp nhận, dẫn đến Anh/Chị nộp lại ngày 19/8 và tờ khai này được hệ thống chuyển về cơ sở 13. Sau khi Anh/Chị yêu cầu chỉnh sửa thông tin về cơ sở 6 vào chiều 19/8, hệ thống đã cập nhật thay đổi, nhưng thông báo tiếp nhận và nghĩa vụ nộp thuế vẫn hiển thị tại cơ sở 13.

Tình huống này có thể phát sinh do lỗi đồng bộ dữ liệu giữa các cơ quan thuế hoặc sai sót trong việc cập nhật thông tin đăng ký thuế. Theo quy định tại Thông tư 105/2020/TT-BTC và các hướng dẫn của Tổng cục Thuế, khi thông tin đăng ký thuế thay đổi dẫn đến thay đổi cơ quan quản lý thuế, người nộp thuế phải thực hiện thủ tục thông báo thay đổi thông tin đăng ký thuế theo Mẫu 08-MST. Trong trường hợp tờ khai đã nộp sai cơ quan, không nên để nguyên mà cần xử lý hủy để tránh trùng lặp nghĩa vụ thuế hoặc phạt chậm nộp.

Nếu để nguyên không đóng tiền và chờ cơ sở 6 tiếp nhận tờ khai cũ (ngày 13/8), có rủi ro:

• (i) Tờ khai cũ có thể không được hệ thống công nhận do lỗi kỹ thuật;
• (ii) Nghĩa vụ thuế tại cơ sở 13 vẫn tồn tại, dẫn đến phạt chậm nộp theo Điều 143 Luật Quản lý thuế 2019 (0,03%/ngày tính trên số tiền chậm nộp);
• (iii) Hệ thống Etax có thể không tự động chuyển dữ liệu giữa các cơ sở mà không có thủ tục chính thức.

2. Hướng dẫn hủy tờ khai tại cơ sở thuế 13

Để giải quyết, Anh/Chị nên ưu tiên hủy tờ khai nộp sai tại cơ sở 13 trước khi nộp lại tại cơ sở 6. Quy trình hủy tờ khai thuế điện tử (áp dụng cho tờ khai 02/TMĐT) được hướng dẫn tại Thông tư 19/2021/TT-BTC và các tài liệu của Tổng cục Thuế, cụ thể như sau:

• Bước 1: Lập Công văn xin hủy tờ khai thuế (không có mẫu bắt buộc, nhưng có thể tham khảo Mẫu 01/ĐNHUY tại Phụ lục Thông tư 105/2020/TT-BTC). Nội dung công văn cần nêu rõ: (i) Lý do hủy (nộp sai cơ quan thuế quản lý do lỗi hệ thống); (ii) Thông tin tờ khai cần hủy (số hiệu tờ khai, ngày nộp 19/8, cơ quan nhận là cơ sở 13); (iii) Yêu cầu hủy và xác nhận không phát sinh nghĩa vụ thuế tại cơ sở đó; (iv) Thông tin người nộp thuế (MST, địa chỉ, số điện thoại).
• Bước 2: Nộp công văn qua Etax (phần "Nộp hồ sơ thuế điện tử" hoặc "Gửi công văn khác") hoặc trực tiếp tại cơ sở thuế 13. Nếu nộp trực tuyến, sử dụng chữ ký số và theo dõi trạng thái trên Etax.
• Bước 3: Sau khi nhận công văn, cơ quan thuế sẽ kiểm tra và ra Thông báo hủy tờ khai (thường trong 3-5 ngày làm việc). Anh/Chị cần theo dõi Etax để nhận thông báo này. Nếu có số tiền phải nộp hiển thị, sau khi hủy, nghĩa vụ sẽ được xóa.

Lưu ý: Chỉ hủy khi tờ khai chưa được xử lý hoàn tất hoặc chưa nộp tiền. Nếu đã có thông báo nộp thuế, có thể cần giải trình thêm để tránh phạt.

3. Quy trình nộp lại tờ khai tại cơ sở thuế 6

Sau khi hủy thành công tại cơ sở 13, Anh/Chị cần nộp lại tờ khai 02/TMĐT tại cơ sở 6 để đảm bảo tuân thủ thời hạn kê khai thuế TMĐT (thường hàng quý hoặc theo quy định cụ thể tại Nghị định 117/2025).

• Bước 1: Kiểm tra thông tin đăng ký thuế trên Etax đã cập nhật đúng cơ quan quản lý là cơ sở 6 (sau yêu cầu thay đổi ngày 19/8). Nếu chưa, nộp Tờ khai điều chỉnh thông tin đăng ký thuế Mẫu 08-MST qua Etax, kèm giấy tờ chứng minh địa chỉ (hợp đồng thuê, giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh nếu có).
• Bước 2: Lập và nộp tờ khai 02/TMĐT mới qua Etax, chọn cơ quan thuế là cơ sở 6. Đảm bảo dữ liệu chính xác, khớp với tờ khai cũ ngày 13/8 để tránh sai sót.
• Bước 3: Theo dõi tiếp nhận trên Etax. Nếu không nhận, liên hệ trực tiếp cơ sở 6 để hỗ trợ (mang theo công văn hủy từ cơ sở 13 làm cơ sở).

Thời hạn nộp lại: Nên thực hiện ngay sau khi hủy, tránh quá hạn kê khai dẫn đến phạt từ 2-20 triệu đồng theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP.

Công ty Luật ACC sẵn sàng đồng hành cùng Anh/Chị để giải quyết vấn đề này một cách nhanh chóng và hiệu quả. Vui lòng liên hệ ngay để được hỗ trợ!.